Pour mesurer l'empreinte carbone des SAF, on prend en compte la fabrication, l'utilisation, le transport et le recyclage ou l'élimination du produit. C'est ce que l'on appelle l'analyse de l'empreinte carbone en cycle de vie. Par exemple pour les SAF issus d'huiles végétales usagées : ces huiles sont produites à partir de plantes, qui, pendant leur croissance, absorbent du CO₂ atmosphérique, par la photosynthèse. Elles sont utilisées, puis recyclées pour fabriquer du carburant. L'empreinte carbone globale de ce SAF est calculée en déduisant le CO₂ absorbé en amont, des émissions générées par sa combustion en vol.